全自动纯净水灌装机主要用于源水的净化，并将处理后的无菌水进行灌装、封口， 后进行一系列的包装。灌装容量一般为350ml、500ml、1L、1.5L等，只要瓶身直径相差不大，瓶口尺寸保持一致，灌装设备则可以通用，只需更换相应拨轮，调整输送高度即可。
全自动纯净水灌装机包括水处理设备、吹瓶设备、理瓶机、进瓶风道、三合一灌装机、上盖机、瓶盖消毒机、出瓶输送、灯检、吹干设备、喷码机、标签设备、包装设备。
的运行过程包括以下几部分：
    水处理部分：源水经抽水泵存入源水箱中，再由高压泵将源水箱中的水依次通过石英砂过滤器（去除源水中主要大颗粒杂质）、活性炭过滤器（去色、去味）、钠离子交换器（去除源水金属成分，软化水质，防止结垢）、精密过滤器（也称保安过滤器，去除部分细微颗粒及细菌，主要保护后续的膜设备）、中空纤维过滤器或纳滤膜过滤器（矿泉水中含有一定对人体有益的矿物质元素，需将其保留下来，根据矿物质元素大小，选择中空纤维过滤器或纳滤膜过滤器，其目的就是去除不需要的杂质，留下有益的矿物质元素）、 终将过滤好的水送入纯水箱，通过臭氧发生器与纯水箱连接，使臭氧与纯水混合， 终变成无菌成品水。这只是小的水处理系统。
    吹瓶部分：通过吹瓶机，在高压气体作用下，将受热后的瓶胚吹成瓶子。当产量不大时，可选择人工上瓶。当产量大时，可将吹瓶机与瓶装水灌装机通过风道直接连接，但前提是吹瓶机产量要和灌装设备产量一致。也可以配全自动理瓶机与瓶装矿泉水灌装设备直连，白天矿泉水生产完后，晚上吹瓶机加班，满足次日的生产需求。至于如何配，需要根据厂家实际情况而定。
    灌装部分：瓶子经风道在风力作用下进入矿泉水灌装机，依次进行无菌水冲洗、灌装、封盖，此三部分集于一个壳体，所以称之为三合一灌装机。在瓶装矿泉水生产设备中，盖子杀菌有两种方案，①配台瓶盖消毒柜，瓶盖消毒后，由上盖机将瓶盖送入理盖器，经滑到进入封盖，②配在线式瓶盖消毒机，首先由上盖机将瓶盖送入理盖器，接着进入在线式消毒机，依次进行消毒水冲洗、无菌水冲洗、风干， 后通过滑到送入封盖部分。
    包装部分：封盖后的半成品经输送还需依次进行灯检（人工肉眼检测，检测瓶内是否存在杂质，做 后一道 防线）、吹干机（吹干瓶身上的水，便于后续的套标或贴标）、喷码机（打上生产日期）、标签机（根据瓶型选择套标或贴标）、包装机（可选择纸箱包装或膜包装），产量大时，还可选用码垛设备，整线全自动化生产。